よくコンピュータ系のサイトで専門用語に解説ページへのリンクが貼られているのを見かけますが、構造的には単語と URL を用意しておき、当てはまる単語にリンクを貼るというものです。

単純に組むとすでに置換した単語を二重に置換してしまうので、少し工夫が必要になります。

<?php
//元となる文章
$str = "ウェブブラウザとはウェブサイトを閲覧するためのソフトウェアです";
 
//単語とURLのリスト
$wordlist = array(
  "ウェブ" => "http://en.wikipedia.org/wiki/Web",
  "ウェブブラウザ" => "http://en.wikipedia.org/wiki/Web_browser",
  "ウェブサイト" => "http://en.wikipedia.org/wiki/Website",
  "ソフトウェア" => "http://en.wikipedia.org/wiki/Software"
);
 
//単語の文字数が長いものから順に並べ替える
uksort($wordlist, function($a, $b){
	return mb_strlen($b, 'utf-8') - mb_strlen($a, 'utf-8'); });

$pairs = array();

foreach($wordlist as $word => $url){
	$pairs[$word] = '<a href="' . $url . '">' . $word . '</a>';
}

$str = strtr($str, $pairs);
echo $str;

今回は「ウェブブラウザとはウェブサイトを閲覧するためのソフトウェアです」という文の用語にリンクをつけています。
単語は配列に $wordlist 登録し、キーが対象語句、値がリンク先です。

途中文字の長い順に単語を並び替えていますが、そうしておかないと「ウェブブラウザ」を置換するより先に「ウェブ」だけが置換され、「ブラウザ」の文字が取り残されてしまうからです。

（2014/05/07 加筆）

コメントで教えていただきましたが strtr は基本的にマルチバイト非対応の関数のため、文字コードによっては誤作動を起こす場合があるようです。
その場合は以下のマルチバイト対応版 mb_strtr() を使うことをおすすめします。

参考: 「マルチバイト未対応の関数をいろいろ対応させてみた」
http://qiita.com/mpyw/items/ceae0ed5285093c76087#2-7